Большое количество полезной информации вы можете почерпнуть из справочников по видеомонтажу, которых в нете великое множество.
Единственное существует масса сайтов, где много воды.
Это плохо, особенно для начинающих.
Очень советую
http://www.videoediting.ru/По теме.
FAT32 здесь не при чем.
FAT32 касается только жесткого диска с его файловыми системами.
Более того проблема FAT32 с его кластерами и ограничениями решается конвертированием диска в NTFS.
Вот ограничения DVD это отдельная песня.
В DVD-Video, DVD-Audio – используется общая файловая система, UDF Bridge Format, а не FAT32!!!
Она является комбинацией Micro-UDF и ISO 9660.
Согласно ограничениям Micro-UDF формата, они не могут быть размером более 1 ГБ и должны быть записаны в виде непрерывной последовательности. Имена файлов должны следовать правилу 8.3 (8 символов – название файла, 3 – его расширение). Все другие файлы, не соответствующие данным правилам, DVD-плеером просто игнорируются.
Вообще ранее это ограничение трактовалось в положительном свете, видеопоследовательность в таком виде рассматривается, как многотомный архив, и при навигации с каждым томом по отдельности работать и быстрей и практичней.